Попробовал CloudPanel (https://www.cloudpanel.io/) и понял, что через неё управлять «зоопарком» хостов/сайтов гораздо проще, не идеально, но большинство типовых/часто используемых функций максимально автоматизированы.
Днём благополучно всё сломал, а вечером восстановил старый вариант, снял с него копию и восстановил на новой реализации.
Продолжаем наблюдение.